2006-03-01から1ヶ月間の記事一覧

8時半から歯医者。クラウンをぱちっと(接着剤で)留めてもらう。日本のようにアフターケアはなさそう。 ジョンに Elber の話はどうだったか聞かれる。 昼はパスタ。YOME さんに職(というか求職態度(^_^;)?)に関して怒られる。 CELOP のブルースに会い、…

Boston College のゴラン・クリロフさんが一緒に働く院生やポスドクを求めています。非常にいい(閑静な)ところにあるいい大学です。ボストンにももちろん近いです。院生でも多分お金は出ます。行きたい人は私かゴランさんに連絡をとってください。

朝、餅を食べていたらクラウンが(今後を暗示するように)取れる。。 というわけで、BU歯医者に初めて行く。明日治療ということに。 サブGミーティング粗視化班に出てみる。しかし、若いもんは宿題しかやってないのか。。 昼は化学科地下のサンドイッチ。 3…

CHARMM フォーラムに質問を投げるも、「難しい」としか返ってこないので、Hayward のアルゴリズムでとりあえず速度から rigid-body motion を抜くことに。Hayward さんにもメール。返事もらう。

昼は御汁粉とうどん。 Donald Fagen の Morph the cat と Sergio Mendes の Timeless を買う。やはり Fagen のはここ10年で最高の出来では。ひさびさに誰が演奏しているか気になる、いわゆる Steely Dan 的聴き方ができる名盤誕生。 フンボルト奨学金絡み…

フッチーは後ちょっとでトラジェクトリ生成できるよう。助かります。 ドイツの森次さんからメールを頂く。速度相関に関しては補正しないとのこと。 YOME さん、位置の相関関数(時間遅れつき)を計算できるようになる。

セミナ準備。 サンドイッチを買う。サラミもなかなかいけますな。 12時半から自分のセミナで、タンパクにおける相関関数の効用について。まあ、入門的にしてみましたが、若い人間は寝てたとか(^^ゞ。ジョンは線形応答の拡張に興味があるよう。来週はまあな…

Donald Fagen. 一部、新曲が聴けます。ここ最近の Steely Dan よりぜんぜんいいのでは。というのもウォルターベッカーがでしゃばらないからか。ライブでも Brite Night Gown は盛り上がりました。

朝はベーコンエッグ。 昼はおしるこ。甘い。 夜は親子丼+カニカマブロッコリサラダ。

TKM さんに最終版をメール。 回転の効果についてうねうね考える。うむ、やはり北尾さんの論文に書いてある!

部屋の中は暑いくらい。窓を開ける。 洗濯。ビールなど買出し。 昼はカポターナパスタ。 パークストリートまで行って夜はマクド。 7時半からオペラハウスで Donald Fagen のライブ。やはり年齢層は高い。平均年齢48歳くらいか。アジアンや黒人はほぼいな…

暑い。16度くらいまで上がるらしい。 1時からサブグループミーティングということで、昼飯はサンドイッチ(チキン)。しかし、4時にしてくれと言われる。。 みながラッセルを探している。人気者か? 頭痛がする中、4時からジョン、ヨンと議論。話をまと…

Guide to Biomolecular Simulations (Focus on Structural Biology) by Oren M. Becker, Martin Karplus. CHARMM の使い方がメインに書いてある、生体シミューレーションの教科書、というか、講義ノートに毛が生えたようなもの。かなり初心者向け。しかし、C…

買い物、洗濯。 昼は辛ラーメン。雨がちょっと降るが、止む。 BU へ。ジョンが来ている。ヨンと話しあって、明日またサブグループミーティングすることに。 というわけで、またノートの改訂。図の容量を減らしたり、回転したり。 つい勢いで Donald Fagen の…

サブグループミーティング用にまとめる。いろいろ図を貼り付けていたら、25メガの pdf ファイルになってしまった(^^ゞ。誰か pdf ファイルで図だけの解像度落とすやり方知らないですかねえ。 その後、いろいろ試すもうまくいかん。やはり図をもっと軽く作…

カイロの TKTK 先生と連絡がつく。Gerhard からもドイツ来てもいいよとメール。 1時から振動緩和班のサブグループミーティング(前回に引き続き、ジョン抜き)。ヨンは能勢フーバーの計算に手こずっているよう。 昼はベツッチでイタ飯。食いすぎ。その後、…

JCP 論文はアクセプトされる。しかし、ちょっと微妙な問題が残ってしまった。。 ミオグロビンの結果は refine していくことで、どんどん KKC さんや Karplus の結果に近づく(^^ゞ。なんとか相関関数までは行く。これからどうするかだな。。

昼はカルボナーラパスタ。 ラッセルらは量子の波束ダイナミクス計算のお勉強。 カンポでエスプレッソ。 夜は鰻丼とオデン残りと大根サラダ。USYM さんによると、今 TKTK 先生はエジプトにいるらしい。何をしているのだろう。。

回転の寄与を抜いて、YOME さん再計算。しかし、何を見るか。。 TKM さんの原稿を更に微調整。これでほぼ完成か。

昼はおでんと餅。 春休みなのにラッセルやヨンは来ているなあ。ラッセルは研究室の外に貼り出してあるボグダンの論文を読んでいた。 計算機センターのマイクによると、ボグダンのゾンビプロセスは放って置いていいと。 カンポでエスプレッソ。MYST くんの NY…

はてなサーチで CHARMM で検索すると殆んどこの日記しかかからん。。

朝は餅3個。計2ドル。 自分のマシンの容量が5ギガを切ったので、いろいろ整理。 シエスタの後、昼は海老パスタ。 夜はネットで注文できる宅配ピザにしようとするも、止めてアカデミー賞を見ながらオデン。 北川研の高影さんからヘムクーリングの論文教え…

MYST 一家は今頃は NY か。洗濯。 昼は焼きキムチうどん。 ボグダンに3年半近く前にジョンに出した応募メールをフォワード。こっちもフンボルト奨学金のことを調べだす。英語の能力を評価してもらわんといかんのか。めんどい。 ボグダンが何か複雑なことを…

ニートは34歳までなのか。。そういう意味ではもうニートではないなあ。

KKC さんやフッチーからメール。返事を出す。 YNO くんにもタンパク回転問題に関してメールの返事書き。

ジョンは学部学生の面倒を見ているよう。 昼はタイ料理屋でドランクンヌードル。スタバでコーヒーとチョコ。 作業。論文読み。机の整理。 早めに帰る。しかし、今日は風が強く寒い。 夜はビーフシチュー。Blue Velvet を見る。デビッドリンチづいている。し…

量子カオスと generalized entanglement の論文を読むが、どうして量子カオス系の人間がこんなに絡み合いに拘らなきゃいかんのかがまず分からん(^^ゞ。もっと他にやることあると思うけどねえ。論文としての質はよくないので、落とすか。。 KKC さんにミオグ…

JCP 論文を全然直さずに再投稿してしまったという夢を見る。。 吉野屋、スタマに買出し。 昼は BU サンドイッチ屋のローストビーフ。 カンポでエスプレッソ。今時の BU 学生問題について。 夜はビーフシチューにカニカマサラダ。Ghost World を TV で見る。…

回転をどう抜くかということに関してボグダンと話す。 JCP 論文はジョンの直しが入ったところで再投稿。

昼はインドカレー。タンドーリチキンがうまい! 今日は BU の居部屋が暑い。ラッセルが修理の人間を呼ぶ。 ISSO でジルに会って DS-2019 と YOME さんの EAD カードの処理。給料の数字のところで揉める。ジル不機嫌になる。しかし、チェックが $175 でなく、…