昼はコンビニ弁当。 KKC さんと来月の授業をどうするか話し合う。 OM 法は Miller-Predescu の近似だと（とりあえず）うまくいかないということに落ち着く。 KGW 先生から＊＊委員会のことを聞く。 夜は昨日の残り＋α。

昼は小杉のてんや。その後、和光へ。 MTNG くんからストリング法の進展について聞く。主に自由エネルギー概算がうまくいくようになったと。その後、金沢のことも聞く。 OM 法で LJ をやるも、どうも変。 夜はブリ大根とタコ胡瓜。

Amber10 をインストールしようとするも、Ubuntu9.10 だといろいろ不具合が。 昼はモンタボーのパン。 経路計算は Langevin のインテグレーターを変えると、長い計算が走るが、ある処でダメになるなあ。と思ったら、ストリング法の部分が変なのか。 SG さんか…

Hiroshi Fujisaki, Yong Zhang, and John E. Straub, Non-Markovian theory of vibrational energy relaxation and its applications to biomolecular systems, arXiv:1003.4796 (to be published in Adv. Chem. Phys.).

久々に晴れた。 昼は YOME さんと、YOME さんの友達と、小杉駅前のタイ料理屋コ！ピーピーへ。辛い。途中で退散。 うーむ、ただ水素付けたいだけなのに、leap がうまくいかん。。 MolFeat の人が来て、主に Mol 造のことについて喋る。いろいろ無茶なお願い…

P. Eastman, N. Gronbech-Jensen, and S. Doniach, Simulation of protein folding by reaction path annealing, J. Chem. Phys. 114, 3823 (2001).

NGI さんとタンパク内のエネルギー移動などについてお喋り。 昼はコンビニ欧風カレー。 研究業績のデータ集め。ACP 論文もプレプリサーバーに投稿。 Eastman の論文を読み直す。なかなかいいことが書いてある。 夜はお好み焼き。ちい散歩（新丸子）が見れん…

今日は冷える。 昼はモンタボーのサンドイッチ。 その後、和光。いろいろ路線が乱れてますなあ、昨日から。 MRTG さんのセミナで、MM-CG 法の細かいところ、multi-copy 法について。 その後、先週の会議に来ていた Marrink や Grubmuller の人物評など。 MRT…

頭痛気味で起きる。 proof を関係者にメール。MOPAC をダウンロードしてみる。 昼はコンビニつけ麺。事務室には氷川キヨシの曲が。。 proof を AIP に送り返す。Gerhard の論文読む。 夜は焼きナス＋洋風キャベツサラダ。

IMAG (Interagency Modeling and Analysis Group).

BSC シンポジウム2日目。 最初の NIH の人の話は印象的。日本にもこんな人が行政にいればねえ。 昼はカレー屋に行く。いまいち味も OL 風といいますか。OGS さんの SF でのホテル話を聞く。 その後、ポスターをチラチラ見る。野口さんの話は相変わらず面白い…

S. a Beccara, G. Garberoglio, P. Faccioli, and F. Pederiva, Ab initio dynamics of rare thermally activated reactions, J. Chem. Phys. 132, 111102 (2010). 先にやられた。。

BSC シンポジウム1日目。 昼にフラッシュトーク。その後、土佐料理の店に行ってからポスター。米沢さんらに聞いてもらう。 その後、Marrink や Grubmuller の話を聞く。 で、分子スケールでお茶。その後、中目黒経由で小杉に帰る。 なんか欠席していたうちに…

昼はコンビニドライカレー。 いろいろ明日のシンポジウムの準備。 夜は恵比寿の韓国料理屋。

朝、古淵のミスドに寄る。 昼はモンタボーのサンドイッチ。いい加減飽きてきたか。。 ２週会。来月は物理が司会担当ですか。 各所にメール。論文査定は続く。 夜は肉じゃがとサラダ。

マルホランド・ドライブ [DVD]出版社/メーカー: ポニーキャニオン発売日: 2002/08/21メディア: DVD購入: 2人 クリック: 128回この商品を含むブログ (276件) を見るKND くんの学会発表練習を聞く。 昼は KND くんとインドカレー屋。Twitter するべきかという…

You Can't Do That on Stage Anymore 2アーティスト: Frank Zappa出版社/メーカー: Vido Arts発売日: 2008/01/13メディア: CD クリック: 1回この商品を含むブログ (1件) を見る日医は卒業式らしい。 昼はコンビニ付け麺。 謝恩会に行くみなさん。 夜は小杉付…

昼はモンタボーの牛肉コロッケパン、カレーパンなど。 LJ の TPS をやろうとするもうまくいかん。。というか、時間刻みを間違えた。。 ５時から研究発表会。文系の人にも分かるような感じで、Onsager-Machlup のスライドを作ってみたが、理系の人しかいなか…

サウスパーク s13e11 Whale Whores

計算物理レポート解説を受講者にメールするも、H さんだけメールが届かん。。 明日の発表会の準備。 昼はコンビニ欧風カレー。 準備続く。 夜は豚肉生姜焼き。サウスパークの「日本人とイルカ」の回を見るも相変わらずすごい。

KGW 先生は、廊下がペンキ臭くなっていると。 昼はコンビニチャーハン。 その後、和光に行って、Kevin 三本松さんのセミナ。リボゾーム+RNA の全原子シミュレーションや、郷モデルを使った構造緩和の話など。いや〜、さすがロスアラモスの研究。 コーヒータ…

D.J. Wales, Discrete path sampling, Mol. Phys. 100, 3285 (2002). まあ、量子論で言ったら、フェルミの黄金則をそのまま計算しているような印象を受けるなあ。

セミナの成績を出す。 ゲラルドからメール来る。何とか Freiburg に行く道を考えんと。。 昼はモンタボーのカレーナンパンなど。KKC さんと皇室問題などについて。 Wales の論文を読んで、2次元LJをやりだす。浅水屋くんのコンサートにも行くことに。 夜は焼…

Steely Dan をギター弾き語りとは！何というアイデア。

確定申告をやりに相模原税務署に。いいお姉さんがついてテキパキ終わる。 論文の再々投稿がうまくいってなかったのでやり直す。今度こそは。。 昼はコンビニ堅やきそば。H さんもレポート来る。あとは Y くんと M さんか。。 来週の研究発表会の準備を始める…

Hiroshi Fujisaki, Motoyuki Shiga, Akinori Kidera, Onsager-Machlup action-based path sampling and its combination with replica exchange for diffusive and multiple pathways, http://arxiv.org/abs/1003.0971

計算物理のレポートがいくつかメール。とほほな気分に。。 論文を JCP に再々投稿。まあ、今度は大丈夫か。ついでにプレプリサーバーにも投稿。 昼はコンビニ付け麺。風邪気味なのでユンケルを買う。。 やっとアメリカ生物物理学会の住所変更も行う。また、…

A. Heyden and D.G. Truhlar, Conservative Algorithms for an Adaptive Change of Resolution in Mixed Atomistic/Coarse-Grained Multiscale Simulations, J. Chem. Theo. Comp. 4, 217-221 (2008). Growing string method もやっている人。しかし、自信た…

Y くんがやっとレポート出した。。 昼はモンタボーのサンドイッチ。その後、理研へ。 3時ごろから FKD さんのセミナ。インテグレーターの分解の仕方を変える話。 その後、サンフランシスコのことなど。しかし、特に面白い話はなかったか。 ISKW さん、MTNG …

総括レポート締め切り。しかし、Yくんだけ来ない。。 昼はコンビニ醤油ラーメン。 LJ クラスターのことをまとめようとするもうまくいかず。。 コーヒータイムはバンクーバーオリンピックやサンフランシスコのことなど。KGW 先生はくやしくて女子スピードスケ…