2008-10-01から1ヶ月間の記事一覧

麻薬の夢で目覚める。TVの影響か。。 レビューした CPL 論文が戻ってくる。なぜ2バージョンあるのか。。 昼は鶏肉天ぷら。書類を修正して KKC さんに送る。 朝永振一郎の鳥獣戯画を借りる。 コーヒータイムは FKD さんの論文探し、選挙ネタなど。 Expedia …

かなり涼しい。13度か。 行がけにアグンさんとちょっと話す。 昼は鶏かつ。その後、KDR さんに昨日の de Groot の論文の心を教わる。 2時から MRTG さんのセミナ。Langevin の摩擦パラメータで水やタンパクの挙動がどう変わるかという話。多次元系の Kram…

Peter J. Bond, John Holyoake, Anthony Ivetac, Syma Khalid, Mark S.P. Sansom, Coarse-grained molecular dynamics simulations of membrane proteins and peptides, Journal of Structural Biology 157 (2007) 593–605.

書類書き。雑誌会準備で今更 TRD さんに Wuthrich の本借りたりして。。 昼は豚肉。論文投稿、レビューなどにまつわる話。 TRD さん、さっそくホームページを立ち上げる。 4時から雑誌会。MR くんの膜の粗視化モデルの話と、私のユビキチンの EROS アンサン…

Art in Motion. アンジェラさん、すごいです。ISKW さんもこんな感じを目指しているらしい。。

早めに目が覚める。 停電後、さっそくジョブ投入。ゲラルドからいろいろメールが。。 昼はタンドリーチキン。一昨日の越生トレッキングの話など。MTNG くんは東京マラソンに出られるのか。 雑誌会の準備。コーヒータイムはグループの HP 作りなど。TRD さん…

6時半ごろ起きて、武蔵おごせハイキングに行く。 17キロコース。しかし、いろいろ親に歩きながら聞いている子供がいて、うるさい。。 途中に30分くらい山の中で渋滞になる。。 YOME さんはバスに乗りそうになるが、なんとか完歩。

雨の中歩く。 ゲラルドからデータの催促。 茅先生がやってきて、部屋のチェック。 昼は魚の天ぷら。IMI さんまた傘を取られたと。。とりあえず2つあるので MTNG くんのを使うことに。 コーヒータイムは Gromacs と Desmond を比較した論文について。まあ、B…

マンションのエレベータが使えないので歩き。 昼はもちもち水餃子。ドル安の話など。たしかに今1ドル97円になっている。。 プリンタのトナー切れる。もっと早く注文しておけばよかった。。と思ったら業者がちょうどやって来た。 コーヒータイムは和光や朝…

IMI さんの写真の撮影者としてサインする。 昼はハンバーグ。TRD さんによる、NMR や X 線回折の実験の実情についてなど。 原稿依頼。お引き受けする。 4時から雑誌会。Warshel の酵素反応と揺らぎのカップルしている話(というか溶媒を反応座標に取り込む…

マットの工事のせいで、6階と7階を間違えた。。 quest がかなり空いた。やはり一時的なものだったか。 TKM さんから論文の proof の連絡。ヨンからも論文を JCP に投稿したとのメール。 昼は豚肉。Shaw に張り合うにはどうすればいいのかなど。 コーヒータ…

玄関の前が防水のマットに貼り変わった。 昼は魚フライ。MRTG さんのオークリッジ話など。 2時から FKD さんのセミナ。これまでのまとめと非平衡系で invariant を探す話。後者は先月のフランスでの研究内容とのこと。こういう話は物理的だが、どう生物物理…

H. Lou and R.I. Cukier, Molecular Dynamics of Apo-Adenylate Kinase: A Distance Replica Exchange Method for the Free Energy of Conformational Fluctuations, J. Phys. Chem. B 110 (2006) 24121-24137.

10時ごろから、川合光さんの「やさしく解説,ノーベル物理学賞解説セミナー」を聞く。これが全然やさしくなくて。。しかし、物性論との比較もあり、久々に物理っぽい話を聞いた。 昼はアジの揚げ物。やはり川合さんの話を聞いていた事務系の人はイジングモデ…

Matthias Heymann and Eric Vanden-Eijnden, Pathways of Maximum Likelihood for Rare Events in Nonequilibrium Systems: Application to Nucleation in the Presence of Shear, Phys. Rev. Lett. 100, 140601 (2008). 非平衡過程をやるには、string 法よ…

MRTG さん、飛行機の出発時間を間違えそうになったらしい。あぶない。 11時から TRD さんの発表。マルチカノニカル法とそのペプチドへの応用。ジョンのところに(今は)いるキムさんのやり方と等価らしい。シニョニンに関しては NMR の実験もされているとの…

理研の MRYM さんは奥さんから性転換しろと言われているらしい。子供も2人もいるし、その方が職がとり易かろうと。。

Circus Moneyアーティスト: Walter Becker出版社/メーカー: 5 Over 12発売日: 2008/06/10メディア: CD購入: 2人 クリック: 3回この商品を含むブログ (8件) を見る(比較的)朝早く出るといろんな人が歩いてる。 昼は牛肉。イグノーベル賞の話、ペタコンを使…

That Lucky Old Sun (Eco)アーティスト: Brian Wilson出版社/メーカー: Capitol発売日: 2008/07/31メディア: CD クリック: 10回この商品を含むブログ (8件) を見るreparameterization のところがうまくいってないようだなあ。バグとる。 昼は豚肉(しかし、…

放送大学「現在の国際政治」を見る。面白い。ジョークを言っても受講生が笑わないのがいい。

Arenaアーティスト: Todd Rundgren出版社/メーカー: Hi Fi Recordings発売日: 2008/09/30メディア: CDこの商品を含むブログ (4件) を見るちょっと風邪ぎみ&頭痛ぎみか。。 昼前に渕上くん現る。 昼はエビシュウマイスープ(よく分からん)。 コーヒーを8人…

議論用にまとめるまとめる。 昼は豚キムチラーメン。研究者の夫婦の関係について。 日本医科大に行き、KKC さんや香川先生に会う。 その後、XOR ネタと免疫ネタで議論。 夜は新丸子の近くの庄や。

Leandro Martínez, Igor Polikarpov, and Munir S. Skaf, Only Subtle Protein Conformational Adaptations Are Required for Ligand Binding to Thyroid Hormone Receptors: Simulations Using a Novel Multipoint Steered Molecular Dynamics Approach, J…

テレビでいろいろノーベル賞関係を見る。南部さんは外人みたいなもんだなあ。 XOR のことをまとめだす。ノート PC 用保護袋が届く。 昼はエビカツ。 4時から雑誌会。ligand binding を steered MD でやるという話だが、まだまだですなあ。 SGT さんは化学に…

Hiroshi Fujisaki and Gerhard Stock, Dynamic treatment of vibrational energy relaxation in a heterogeneous and fluctuating environment, J. Chem. Phys. 129, 134110 (2008) (10 pages). 奇遇にも米原さんの次。

マンションの外の作業用 scaffold がほぼ外された。 ゲラルドから論文が載ったとメール。Tully's でスタンプカードのただコーヒーをもらったらグランテにされてしまった。。別にショートでよかったんだけど。。 昼は鶏肉プルコギ。うーむ。 KKC さんとの議論…

Mt. Fuji's web site.

ちょっと早めに来て文献整理。テプラ使いになる。 HTTR くんハワイから現れる。すばる望遠鏡のことなどをやっているらしい。 昼は韓国焼肉屋。その後、Tully's. これからは脳かという話。 HTTR くんからもらったコーヒーを淹れる。MRTG さんはオークリッジで…

Perfume - Ceramic girl another version

昼は焼きそば。 IMI さんとシクロデストリンに string 法が使えないかという話など。 やっとこさアメリカ生物物理学会申し込み完了。