翻訳進める。いい加減、統計数理の原稿もやらんと。。 昼はそば。 朝倉・大澤理論60周年国際会議というのが3月にあるらしい。ジョンも喋る。 4時からキサンチンの打ち合わせ。ミューテーションをどうするか、BOF をこれからどう解析するか。 夜はどこの飲み…

水谷さんとヘモグロビンのことで一頻り議論させてもらう。 昼はインドカレー屋。水谷さんはプレオフ会に。。 KGW 先生と ASI 先生らが来る。フルーツをいただく。 ゲラルドからメール。数日で上げないと。。 夜は牡蠣弁当。

ゲラルドには前日にドラフトをメール。YG くんとも振動計算でやり取り。 昼は日高屋でチゲラーメン。 MPIはやっと動くようになる。アポへモグロビンの計算を流す。 3時から紀要委員会。今後どうするかについて。 夜は爆弾丼。711のチキンは蛇足だったか。。

マルコムX [DVD]出版社/メーカー: パラマウント・ホーム・エンタテインメント・ジャパン発売日: 2006/11/02メディア: DVD購入: 4人 クリック: 22回この商品を含むブログ (71件) を見るスーパーホテルで朝飯を食ってから奈良女。 KSD さんの修論続きを見る。…

奈良行き。しかし、FJ さん発熱との連絡。 昼は新横浜でチゲラーメンとチャーハン。 KSD さんと修論の件で議論。Elastic network server を皆に見せようとするも、マックだとなんかうまくいかん。。Java の問題か。 夜はキムチ鍋と豆腐鍋。接尾語に「なんと…

かなりの冷え込み。しかし、家のプリンタがつながらん。。 昼は赤羽でバル定食。 芝浦１０回目。2体問題続きと万有引力、トルクのファインマン流説明。 夜は赤羽で炙り豚丼。今度はナポリタンを試すか。。 tier の追加計算。MPI はホスト１だけでうまくいか…

HPCシステムズが来て作業。いろいろ書類処理。 芝さん、TD さんらと奈良行きの件でメールのやりとり。 昼はコンビニ牛肉弁当。 ゲラルドに言われた件をいろいろ直す。 MMPBSA は結局 Ambertools12 にしても解消せず。何かコンパイラの問題か。と思ったら MPI…

Zuckerman はだいたい8章も終わる。あとは熱力学の7章のみ。。 昼は魚武でウニ丼。 TPS 軌道を圧縮圧縮。さすがに 100G もあると大変。。 忘れていた書類をいろいろ提出。紀要の42号が出る。 YG くんにお助けメール。しかし、時間的に無理か。。 夜は野菜肉…

２週会。特プロの件の詰めなど。NKMR 先生と話す。 昼はやきとん屋で鯖の塩焼き。振動計算の問題点など。 シニョリンのTPS は後ろ向きがほとんど reject されるな。。これは系の性質として仕方がないのか。。

ゲラルドから tier の論文を Skinner 還暦号に出そうというメール。 物理中間試験。セミナの資料を配ろうとするも3人しか来ん。。 昼はインドカレー屋の3種のカレー。半ナンを追加。これが後で痛い目に。。 夜はとんかつ屋で新丸子忘年会。最初からとんかつ…

昼は赤羽でベーグル。 芝浦工大9回目。2体問題入門。角運動量とトルクなど。N体問題とかに時間かけすぎか。。 Abhi とひさびさにチャット。もう彼のパス探索アルゴリズムのコードが Stock 研にあるのか。 夜はお好み焼き。

特プロのシラバスの件など。 嘱託の人には書類を送ってもらう段取りに。 立川の叔母さんがなくなったという連絡。 夜は。。

かなり寒い。千駄木で例の作業。お弁当。 帰って TPS 実装続き。いろいろ溜まっているメール処理。

10時半に来る。KKC さんは提出終了。 その後、Huzinaga 先生のことなどで一頻り話す。 昼はMT先生、KKCさんと nappa69 で。 KKC さんの Rc-BOF の軌道を見始める。これの解析と自由エネルギー計算から。。 TPS 実装もまずは初期パス作りから。これがないと始…

昼は甘エビそば。 東京の寺田さんのお見舞いで地下鉄赤塚まで。ひさびさに KDR さん、MRTG さんらを交えて話す。 その後、MRTG さんとジョナサン。ついでに思い出して、MTNG くんとチャット。 帰って、例の作業。TPS 実装も続く。 夜はタイカレー。

芝浦工大８回目。2次元のエネルギー、線積分、偏微分。これまでのまとめ。 TPS 実装をちょっとやる。 夜はお寿司、おでん、菜っ葉のひき肉炒めなど。

お歳暮送る。 昼はとんかつ屋でひれかつ定食。 例の作業。それから TPS 実装再開。

（上書きして消してしまった。。） 物理実験６回目。 昼は鮮魚屋のお寿司。700円でリーズナブル。 例の作業も進める。 夜は豚肉と白菜煮。

Zuckerman 9章も大体終わる。あとは7,8章。。 昼はしぶそばでかき揚げどん＋そば。 午後は例の作業。大詰め。 分子シミュレーション学会誌用のパスサンプリングの原稿もとりあえず SG さんに送る。 夜は小杉駅前にできた塚田農場。樫村さんも来る。

Jens の論文を読む。 昼はバーガーキング。ランチメニューあるわけね。 2時頃TKMさんやってくる。時間並列やマルチスケール解析の話。 夜はひさびさ文福。物理のイデアを分からす必要はない、アルゴリズムだけで十分という話など。

Eric からは日本に来れるよということになったので、こちらのほうで日程調整。 芝浦工大7回目。2次元以上のエネルギーの定義、線積分など。 光武さんに言われて、ポスターから口頭発表に。。 SNase のことでメールが飛び交う。。 1月末の志賀さん企画のレア…

ちと暑いか。 昼は栗おこわとカレーコロッケパン。 庶務課に電話。SGWR さんに忘年会費を払う。 アポヘモグロビンと戯れる。昨日送った TPS 原稿の直しがいろいろ来る。。 夜はハンバーグ。コーヒーの香りで優しくなるか。。怒りっぽいと心臓病が防げるとい…

Masayoshi Takayanagi, Ikuo Kurisaki, and Masataka Nagaoka, Oxygen Entry through Multiple Pathways in T-State Human Hemoglobin, J. Phys. Chem. B, 2013, 117 (20), pp 6082–6091.

ちと寒いか。 学生物理実験5回目。 昼は小杉駅のおにぎり。 分子シミュレーション学会誌の草稿をみなに挨拶がわりに送る。。 TPS のやり直し。OHR さんに科研費残りを聞く。 夜はタイカレー。

何回かバックアップからの復元を繰り返し、やっと iPad が元に戻る。。 昼はコンビニ野菜ラーメン。 サイエンス社から数理科学送られてくるも、伊庭さんのおかげか。 アンサンブル原稿書き。いい加減まずい。さて Eric にも招待メール送る。 KKC さんといろ…

Hummer のベイズ推定の話が何となくわかってきたような。。 伊庭さんに Vanden-Eijnden 用の招待メール草稿を送る。 共立の SKI さんには遅れることを電話で連絡。申し訳ない。 昼はやきとり屋のサービス定食。 2時頃 FJ さんやってくる。TPS 軌道の解析のこ…

Hummer のベイズ推定の話がまだ腑に落ちん。。 芝浦工大６回目。強制振動続きと運動量・エネルギー入門。 夜は水炊き鍋。リーガルハイを見てしまう。。

いろいろやることが溜まってきた。。 昼はマクドでチーズバーガーセット。こればっか。 SNase はうまく行ってるかどうか分からんので、みなにメール。 分子シミュレーションの原稿は4ページまで。。 共立の SKI さんに連絡。延ばしてもらえるか。。 文科省の…

物理実験4回目。だいぶ速くなっている。 昼はコンビニまかない風パスタ。 しかし、オリジナルのTPS はいろいろ問題があって悩ましい。。 ResearchGate 経由で訳のわからんメールが来ているが、無視するか。。 TPS は shifting move もちゃんとやらんとダメか…

G. Hultqvist, et al., Energetic Pathway Sampling in a Protein Interaction Domain, Structure 21, 1193-1202 (2013).