Agmon-Hopfield を読んでいるうちに寝てしまう。 昼は冷やしそば。その後、BU で STATPHYS の様子を見てから、こすいこと続き。 いろいろメール出す。スタマで買い物。５キロマラソン。 夜はハンバーグ。

VNC のことを更に学びたい場合。

Agmon-Hopfield の ligand-binding の論文 [J. Chem. Phys. 79, 2042 (1983)] を読む。

KKB くんから CPL 論文に関してメールもらう。高田さんの論文読み続き。 昼は冷やしうどん。ヨンといろいろ議論。いや〜やはり議論するのは楽しくていいわ。Kim さんにも INM のことを聞かなければということになる。 ティーパーティがなさそうなのでスタバ…

WinSCP. sftp するためのWindows 用クライアント。

ジョンに言われてパワポ作り。 昼はパスタ。サミュエルアダムスは夏用のビールが出る。 こすいこと続き。ジョンのプロポーザルを読んでいるうちに、高田さんの粗視化モデルの論文 [J. Chem. Phys. 110, 11616, (1999)] も読みたくなってくる。 ２日連続で５…

H. Kokubo and Y. Okamoto, "Self-assembly of transmembrane helices of bacteriorhodopsin by a replica-exhange Monte Carlo simulation," Chem. Phys. Lett. 392, 168 (2004). こういう分かりやすさを目指さないとなあ。自分も。

相変わらずγの意味は何か。Met80-3d でやっとけ。共鳴してそうなとこだけ計算せよ。などなど。しかし、ジョン以外は反応が薄い。こんな話を高校生の前でしていいのかという気にもなる(^^ゞ。

１０時過ぎから自分のセミナ。 昼はインドカレー。プリティのとこに花束が届けられる。 いい加減、フィラデルフィア行きの準備もしなければ。 ISSO の Jane にも work permission の件でメール。 こすいことをやり出す。５キロマラソン。 夜は冷やしうどん。…

とりあえず水中のチトクロム c を 20 ps ほど走らせて時系列を採ってみる。

Proof を郵送する。 CHARMM tutorial をいまだに見ている私(^^ゞ。しかし、ヨンはしっかりしているなあ。 昼はキムチうどん。 夜は焼きナス。しかし生姜がないので、雨の中スタマまで走る(^^ゞ。

時系列解析もいい加減やりだす。

昼はサンドイッチ（ターキー）。 セミナ準備をいい加減終わらす。MYZK さんからいろいろ教わる。 昼のコーヒーが不味かったので、２度目飲む。文献整理。 PRA 論文の proof が来ないと文句を言ったら、早速来る。 明日から雨だと言うので買い物。下の階の住…

昼はパスタ。 やたら Fire alarm がちかちか言う BU 化学科。 セミナ準備は続く。５キロマラソン。 夜はカレー。

昼はMYZK さんとインドカレー。なにか一緒にやるかという話に。 その後、コムアブ (Commonwealth Ave.) に沿って散歩。MYZK さんと別れて、BU 本屋でフラペチーノ。 その後、自転車でマスアブ (Massachusetts Ave.) に沿って、ポーターまで行く。三角コーナ…

いろいろ folding 関係の最新論文を打ち出す。 仕方ないんで、古典非平衡MDをやりだす。

午前中は寝倒す。 昼は冷やしうどん。 Tea party. ジェニファーは BU を抜けて癌研究所の office work をやるらしい。Coker 研の学生に split-operator 法のことを教える。 BU 本屋で本の注文。買い物。 夜は鰻丼。

非断熱半古典は謎だらけ。

TKM さんから草稿が送られてくる。セミナ準備。 昼はパスタ。YOME さん、渡辺オーナーの発言に一抹の清々しさを感じると。 セミナ準備をいい加減終わらせんと。ジョンのプロポーザルの校正をちょっと手伝ったりとか。 ４キロマラソン。と思ったら、後で６キ…

上の階のエアコンから垂れてくる水音でよく寝れん。 ジョンのセミナはタンパクの変性と凝縮に関する尿素 (urea) の効果について。Kramers turnover のような面白い turn over (chevron) があるらしい。また、尿素と水が混合した系の MD は難しいとのこと。 …

CRC ソリューションズ。おめでとうございます。

２次元 Herman-Kluk ごときではまっている私(^^ゞ。なんとか切り抜けたか。しかしまた謎発生。 チトクロム c の平衡MDの準備。

昼はサンドイッチ（チキンとでかいチーズの入ったやつ）。 お、また高校生が夏休み研究でやってきた。 とりあえず発表はしないけれどもアメリカ化学会には行くことに。 Phys. Rev. は全部電子的にやればチャージされないと思いますが → YSIK さん。 プリティ…

ミドルネームを J にしようかなとか思ったりする。H. Fujisaki は最低３人はいるんですよね。超弦理論の人と、情報処理の人と私と。

振り替え休日。ボストンポップスのビデオを見る。David Lee Roth はなんか痛々しいなあ。やはり花火に予算を割きすぎて旬のミュージシャンが呼べないということか。 ３キロマラソン。SGT さんにとある論文を査読するように言われるも、やばそうなので他の人…

独立記念日。ボストンコモン辺りを散策。 今日のボストンポップスのコンサート会場周辺をうろつく。帰って掃除洗濯。 夜は鰻丼。花火を見る。写真に撮ろうとするもシャッターチャンス逃しまくり。

昼はインドカレー。ああうまい。 買い物。３キロマラソン。 夜はうどん。

タンパクのミニマリストモデルのお勉強。

ばて気味で午前中は寝倒す。 昼はカレーうどん。MYST くんにメール。 いろいろあって、tea party. レナにローズマリーの赤ちゃんの話をしようとするも逃げられる(^^ゞ。ジョンは奥さんと子供連れてきている。子供にコピー取りをさせている。 夜はピザ。リン…

どういう風に前因子を滑らかにつなぐかで悩む。それは解決するも、相関関数がうまく計算できん。 NEMD もやはりゼロ点振動エネルギーの問題がネックだなあ。ともに dead lock か。