Tetsuya Morishita, Satoru G. Itoh, Hisashi Okumura, and Masuhiro Mikami, Free-energy calculation via mean-force dynamics using a logarithmic energy landscape, Phys. Rev. E 85, 066702 (2012) [5 pages]

物理演習の成績付け。 昼はコンビニネギとろ丼。 その後、理研へ。コーヒータイムは研究者のパトロンシステムについて。 ６時半から池袋で FKD さんの送別会。だというのにいろいろ暗い話。

物理実験演習3回目。ちょっと間をもたす。 昼はコンビニエビパスタ。 パスのことを調べているうちにアンブレラサンプリングのほうが分からなくなってきた。。 夜は軽くさくら水産。FJBYS さんは明日から台湾と。

午前中は物理学会に出向く。ポスターでパスサンプリングの有益な話を聞く。だいたいこういうのは吉川研関係の人。 帰って、KKC さんと予算関連の話など。 2時から医学入門の打ち合わせ。その後、医学入門。禁煙について。 名古屋行きの準備。しかし、OM ダイ…

物理学会に出向く。 TD さんと wavelet 関連の意義について。自分の中でなんとなく落としどころが見つかったような。。 昼は横浜国大の生協。 午後は生物物理と化学物理のセッション。奥島さんや宮崎さん、首藤さんにも半年ぶりに会う。 量子カオスの議論を…

２学会の準備を今日中に終わらせんと。。 光武さんにも嘱託の件お願いする。 昼はコンビニ冷やし中華。 TD さんのスライドにダメだし。こちらもスライドを送る。。 夜は香ばし御膳（ケンタ）。

物理実験用演習2回目。光に関わること（干渉、屈折、光電効果）。寺田物理も盛り込む。 昼はコンビニパスタ。 しかし、スポーツ演習の後ということもあり、だらけている。。 KND くん、自炊しまくる。その後、本郷に行き、旧 TKTK 研の人その他の分子科学の…

洗濯。 昼はマクド。2週会で特プロの進捗を話す。 奈良女のポスター2件に関してコメントメール。 KKC さんと来週のことなど話す。 歯医者。スタバ。Softbank に寄るも iPhone5 の予約者でいっぱい。やめる。 夜は。。

嘱託の候補がいないか方々にメール。 再試験の結果を貼りだし。クラスターから外部に行けるように。物理用のメアドももらう。 昼はコンビニ寿司。 3時から新科研費の集い。雑談してから、小一時間喋る。SG さんが加水分解ネタにこだわる。 その後、夜は3人で…

町田のスタバで論文読み。 昼はとろろそば。 物理の再テスト。まあ、大丈夫そうか。 分子振動の古典力学をやろうにもエネルギーが保存しない。。やり方を変える。 夜は腹が減らないので適当に。。昨日食いすぎた。。

MTNG くんが変えたら、OMパスがさらによくなったぞ。 物理学実習１回目。いろいろ新しいので、まごつく。 昼はコンビニパスタ。富士通が新入社員500人だという話。 MTNG くんと FB チャットして OM パスをいろいろ調べる。結局 integrator の問題かと。 夜は…

TD さんにいろいろ注文を出す。 昼はコンビニ冷やしパスタ。 OM 法はまだおかしい。。MTNG くんといろいろやりとり。 階層モデルのほうは古典ダイナミクスのほうをやってみる。 Google Document に授業関連のことをアップしてみる。 夜はキャベツの豚肉と春…

町田のスタバで論文読み。FJ ちゃんからメール。 昼は小杉で漁師丼。 RA のことで近藤さんや泰地さんに聞いてみたり。 OMダイナミクスがかなり変な挙動。どうする。。 夜は小杉の Becks でハンバーガー。うむむ。。

AK 関連の査読論文はメジャーリビジョンで出す。しかし、変な論文ばかり来るな。。 嘱託の人々にメール。スケジュールが固定するまでしばらくかかりそう。 昼はみなと庵でとろろそば。 HF-OM のトラジェクトリの解析に入るも、変なことが起こっているな。。 …

PRE 用の査読論文を読む。これはリジェクト。と思ったら AK 関連で別口も来る。。 Luca からも TAMD の論文が来るが、これは読んで意見くれということか。。 昼はコンビニ冷やし中華。 2回目の演習はなんとか目途がつく。これから実験と Excel をやらんと。…

町田のスタバで kernel CCA の論文読み。 昼はコンビニ冷やしジャージャー麺。 tier はとりあえず計算のレベルを変えてやってみる。 ひさびさに歯医者。IIDK さんに理研セミナで「生体分子の分子動力学に対する時系列解析」関連をやってくれと言われる。 MSE…

イタリアの KKC さんにいろんな件でメール。 昼はコンビニ冷やし月見うどん。 科研費説明会で OHR さんに会う。HSB さんや NKMR さんと帰る。 というわけで、「構造変化と量子ダイナミクス」（仮題）で分担見込みの方々にメールしてみる。。 夜はシーフード…

町田のスタバ。しかし、メールが来てすぐに日医に。 昼はコンビニ野菜パスタ。 NKMR 先生と、紀要と特プロのこと。 授業の準備。屈折、回折、干渉まで。 夜はみなと庵でつけ天。 Rubtsov の実験の MD を始める。

D. Antoniou and S.D. Schwartz, Toward Identification of the reaction coordinate directly from the transition state ensemble using the kernel PCA method, J. Phys. Chem. B 115, 2465 (2011).

暑い。34度か。。YOME さんは一路、高知へ。 昼はコンビニ冷やし担担麺。速達でブツを出す。 その後、理研。ISKW さんはいなかった。。MRTG さんと今後のこと、FKD さんと阪大の寮のことなど。 kernel PCA で調べてたら、Schwartz がやってる。つばつけるの…

ある戦慄 [DVD]出版社/メーカー: 20世紀フォックス・ホーム・エンターテイメント・ジャパン発売日: 2012/05/11メディア: DVD購入: 15人 クリック: 1,141回この商品を含むブログ (19件) を見るジョンや OKMT さんとのやりとりも終わり、これで1年4か月後か。…

10時に日医で待ち合わせて、MTNG くんが作業。 昼はみなと庵でそば。その後、スタバでパスアンサンブルの時系列解析の話と、パスアンサンブルの摂動論の話。 ジョンの来日関係でいろいろプロポーザル書き。学振ともメールのやりとり。 いろいろインストール…

昼はコンビニカレー。その後、立川の統計数理研へ。 IB さんの話を3時間半聞く。帰りは WSO さんと一緒に立川まで。 夜は立川でカニチャーハン。その後、小杉で MTNG くんが作業。

久々に歩いて町田のスタバ。 昼は小杉駅前の漁師丼。 KKC さんと授業のこと。KMD さんはアブストをサブミット。 MMPBSA のパラレルが多分ちゃんとインストールできてない。。 ジョンと日本行きのことでいろいろやりとり。 光に関する授業90分を計画。その後…

NKMR 先生と紀要関連。 昼はコンビニ冷やし中華。 KKC さんと来週以降の件について。 kernel PCA がどう使えるのか考える。。 エディタにもエキシトンモデルのことでメール。 夜は中華風つくね。

11時から KGW 先生、TKD 先生といがらし。 その後、水銀温度計探し。まあ、特に見つからないか。。 Dan Zuckerman にメールしたら、版権のことはあっさり解決。どうせこういうことだと思ったよ。。 ボストン行きの書類がようやくそろう。OHR さんに学内便。 …

TKD 先生と計算だけで進むときにはどうするかという話。 10時ごろ KDR さんがやってくる。MSES-OM や dominant pathway analysis の話など。パスアンサンブルの情報をもっと活用しないとと。 昼はみなと庵でつけ天。やはり量が多い。 中間評価の書類を出す。…

昨日は samba の件で不毛な時間を過ごす。。 武蔵境の件で会合。NKMR 先生から紀要の件で電話。 昼はコンビニパスタ。物理 HP 作りも始める。ってパクリですが。。 北畑さんに計算機室の電源のことで電話。明日の議論の準備。 夜はイオン寿司。ランダウ・リ…

GRC から集合写真が送られてくる。 昼はコンビニ寿司。自己点検年次報告のデータをメール。 学生実験関連のHP作り、指導書作りも再開。 夜は菊名でそばを食ってから南町田。Dark Knight Rises を見る。終電で帰る。

寝たおす。と思ったら、クラスターがおかしくなっていると。 昼は焼きそば。その後、新丸子。 クラスターはフルに動かすと電気が足りなくなるということらしい。。 Y-700 の問題について考える。出張願いを出す。 MSES-OM に関して、昨日の SG さんと話した…