昼はシーフードカレー。 埒が開かないので、Adib にメールしてみる。 コーヒータイムはモギケンのことなど。 みなでぶらっと靖国神社近辺の花見。その後、飲み会。USUI さんにウォッチメンを見たか聞かれる。

SG さんとさらに経路積分に関するメールのやりとり。 昼は豚肉。Platypus の話は続く。 コーヒータイムは MTNG くんの引っ越し話など。 most probable path と average path の違いで混乱。うーむ。 夜は親子丼。

[rakuten:book:13144935:detail] ひさびさに風邪薬を飲む。破壊措置命令って格好いいなあ。 昼は粕漬け魚焼き。臼井さんらと花見の予定など。 パーミンダーにあまり参考にならないメールを書く。 コーヒータイムは越谷レイクタウンやウォッチメンのことなど…

Walter Nadler, Jan H. Meinke, and Ulrich H. Hansmann, Folding proteins by first-passage-times-optimized replica exchange, Phys. Rev. E 78, 061905 (2008).

洗礼 3 (ビッグコミックススペシャル)作者: 楳図かずお出版社/メーカー: 小学館発売日: 2009/02/27メディア: コミック購入: 4人 クリック: 14回この商品を含むブログ (23件) を見る別のルートで歩くも３５分の壁は越えんなあ。。 昼は海老フライなど。Platyp…

Nilanjan Ghosh, Xavier Prat-Resina, M. R. Gunner, and Qiang Cui, Microscopic pKa Analysis of Glu286 in Cytochrome c Oxidase (Rhodobacter sphaeroides): Toward a Calibrated Molecular Model, Biochemistry 48 (2009) 2468–2485. Edward Harder, Al…

アーネスト・サトウに関する番組を見る。 昼はハンバーグ。ショッピングモールや志賀伝説の話など。 お花見は靖国神社に行くことに。。 ４時から雑誌会。Cui らの QM/MM を使った pKa 計算と Roux らの分極モデルの話。 １次元の拡散を見ているだけなのに、…

Y. Matsunaga, S. Fuchigami, and A. Kidera, Multivariate frequency domain analysis of protein dynamics, J. Chem. Phys. 130, 124104 (2009). MTNG くんの論文。

田辺聖子は元気だなあ。 昼は鶏肉てんぷら。Fedex やライアンエアーについて。 粗視化モデルと全原子モデルをどう連動させて解くかについて皆でブレインストーミング。MRTG さんのアイデアで皆盛り上がる。 １次元系に戻るも何かおかしい。。 夜はラム肉ステ…

パーミンダーからメール。次のポスドク先を探していると。 昼は何か忘れた。。Tully's に行くと、みな野球を見ている。 ２時から FRT さんのセミナ。FOM の MD 計算と one-click MD の現状について。 ４時半から平田先生の話を聞く。興味深いが途中で抜けて…

Repo! を見る。まあ、普通のロックオペラだが、パリス・ヒルトンが出ていると分かっていれば買わなかったな。。ていうか、明日から日本公開か(^^ゞ。 昼は焼きそば。その後、理研。 KKC さんと論文の件でチャット。 夜はピザと野菜。

頭痛で目覚める。アスピリン飲んでまた寝る。 OM 法に string 法の reparametrization をかませると何か変。 昼はそば。 ISKW さんにシャトー・ムーラン・オーラロックをプレゼント。 コーヒータイムは周辺の花見ポイントについて。 いろいろ書類作成。 夜は…

M. Habeck, M. Nilges, and W. Rieping, Replica-Exchange Monte Carlo Scheme for Bayesian Data Analysis, Phys. Rev. Lett. 94 (2005) 018105.

IMI さん、２階に引っ越し開始。 David (Leitner) からエネルギー移動の論文が送られてくる。小樽で聞いたもの。 昼は固焼きそば。今後どうするかなど。 ３時から雑誌会。TRD さんは NMR によるタンパク構造決定を Bayes 推定でもっとうまくやるという論文。…

Thomas F. Miller III, Eric Vanden-Eijnden, and David Chandler, Solvent coarse-graining and the string method applied to the hydrophobic collapse of a hydrated chain, PNAS 104 (2007) 14559-14564.

洗濯。 KDR さんにドイツ勢の論文の査読を頼まれる。 昼は鳥の唐揚げ。ボストンの話など。 KDR さんと進捗を話す。その後、MTNG くんのセミナ。Particle Filter のその後。 コーヒータイムは万博公園周辺の話など。 明日の雑誌会の準備。というか私用により(…

洗濯ののち歯医者。 昼は風風ラーメン。別ルートで理研まで歩く。 コーヒータイムはゴンさんが来て、上海に帰る話など。中国全土が日本並みになるには５０年はかかると。 Onsager-Machlup 法と string 法の比較。 夜は刺身など。

ISKW さんに新幹線の予約を頼もうとするも、自分でえきねっとでやったほうがよいことに。 KMTZK さんから論文の催促。ジョンはどうしているのか。あと図の著作権をどうするか。。 昼はマグロかつ。昨日のナノシンポジウムの話。 経路積分計算は２次元へ。

G. Hummer and I.G. Kevrekidis, Coarse molecular dynamics of a peptide fragment: Free energy, kinetics, and long-time dynamics computations, J. Chem. Phys. 118 (2003) 10762. Q. Shi, P. Liu, and G.A. Voth, Coarse-graining in Interaction Spac…

税務署行ったり、書留受け取ったり。 昼は旧川越街道沿いのラーメン屋。そんなに大した味でもないか。。 コーヒータイムはボストンのカレー屋、明日明後日をどうするかなど。 ４時から雑誌会。Hummer-Kevrekidis の Coarse MD と、Voth らの force matching …

寝たおす。。洗濯、ゴミ捨て、買出しなど。 ピョンからもメール。RNA のエネルギー移動論文を送ってもらう。 昼はそば。 ISKW さんに大阪のスーパーホテルを予約してもらう。IMI さんと同じ。 コーヒータイムはスーパーホテルのこと、キムさんのことなど。 …

A.B. Adib, Stochastic Actions for Diffusive Dynamics: Reweighting, Sampling, and Minimization, J. Phys. Chem. B 112 (2008) 5910.

[rakuten:otagai:10069042:detail] ひさびさに理研。自転車に乗る IIDK さんを見かけたような。。 ボストンの残務処理。Amandeep からもメール来る。 昼はビーフシチュー。 コーヒータイムはボストン話など。FCGM くんの原稿に目を通す。 ４時半から歯医者。…

７時半に Jurys Hotel に集まって、タクシーでローガン空港へ。 JFK で FUJIKAWA さんのチケットだということに気がつくが、すぐさま変えてもらえる。 成田行き機内では 007 慰めの報酬、地球の静止した日、ビバリーヒルズチワワを見る。 成田からは MR くん…

MR くんと一緒にシャトルバスで会場に向かう。 計算生物物理のセッションを聞く。Roux のところの OM 汎関数の話はちょっとねえ。 会場で高い昼飯を買い、ポスターを聞く。Keyes 研のシャナディーンにも会う。フォールディングに対するシャペロンの効果を粗…

晴れ。しかし、気温は非常に低い。−８度ほどか。 コプリー近くの Filene Basement に行くも何もなく、コプリープレイスに行くも何もなく。。 とりあえず Barnes & Nobles のスタバで時間を潰す。 で、電車に乗って会場へ。自分のポスターを貼る。まだ結果が…

吹雪いてますよ。もう２０センチくらいは積もっているか。 ホテルの朝食というのを頼んでみるが、なるほど、これは値段相当のものを出すなあ。 Lechmere のギャラリアモールに行ってみるも、雪でほとんどの店が閉まっている。。とりあえず BestBuy で DVD を…

予報通り、朝から雪がぱらぱら降ってくる。 朝はカレー残りとアーリントン駅近くのスタバでコーヒー。 ９時半に MYST くんと BU に向かう。しかし、電車が来ない。。 BU でキムさんと会う。２年ぶりか。しかし、Straub 研部屋は汚くなっているような。。日本…