2006-01-01から1年間の記事一覧

I.T. Arkin, "Isotope-edited IR spectroscopy for the study of membrane proteins," Curr. Opin. Chem. Biol. 10 (2006) 394. これと Curr. Opin. Struct. Biol. を混同していたことが後で発覚。

昼は辛ラーメン。 6キロマラソン。 YOME さんは変なゲームにはまっている…。 夜はとんかつ。家の中が油臭くなる。。 二十日鼠と人間を見ようとするも見れず。明日は見んと。。

A. Nagy, V. Prokhorenko, and R.J. Dwayne Miller, "Do we live in a quantum world? Advances in multidimensional coherent spectroscopies refine our understanding of quantum coherence and structural dynamics of biological systems," Curr. Opin.…

なかなか最近起きれん。。 昼は昨日の夜のパスタのせいで胃もたれするので、なし。 VCI 計算ははまる。YG くんにお助けメール。 スタバ。いかに派手なことをやるかについて。 夜は海老豆腐。ゴランさんからもらったクロアチアの酒を呑むも度数が高すぎて撃沈…

A. Caflisch, "Network and graph analyses of folding free energy surfaces," Curr. Opin. Struct. Biol. 16 (2006) 71. 昨日キムさんに勧められた論文。興味深い。

体調が悪いので自宅作業。なまけているだけのようにも。。 昼は納豆うどん。 VCI 計算の収束性でまたまた悩む。というわけで、YG くんとチャット。(元)TKTK 研の面々は呑み会があったようですな。。 夜は鮭パスタ。明らかに食べすぎか。オーメンを見る。

D.T. Crommelin and E. Vanden-Eijnden, "Fitting timeseries by continuous-time Markov chains: A quadratic programming approach," J. Comp. Phys. 217 (2006) 782. ラッセルから勧められたもの。これは物理的だし、いいかも。

早速ドイツ勢から返事メール。速いなあ。 12時からラッセルのセミナ。Diffusion kernel とやらの話だが、さっぱり分からず。しかし、バイオインフォでは非常に重要らしい。 その後3時からカーボンナノチューブの実験の話だが、何が面白いのかさっぱり分から…

H. Gohlke, C. Kiel, and D.A. Case, "Insights into protein-protein binding by binding free energy calculation and free energy decomposition for the Ras-Raf and Ras-RalGDS complexes," J. Mol. Biol. 330 (2003) 891. MYST くんから勧められた論文…

語学学校から12月29日から泊まって大丈夫だとメール。というわけで、29日に行くことに決めて、デルタ航空でチケットを取る。 Stock 研の Roman からもメールくる。真面目そうだなあ。 昼はうどん。 VCI 計算の続きと振動緩和計算。スタバ。 夜はアボガ丼+ホ…

Sonja から保険のことでメール来る。Amnet にドイツ行きの旅券の問い合わせ。 昼は辛ラーメン。今日も重役出勤か。。 Gerhard に論文関係のメール。ヨンは CPMD メーリングリストに懸案事項をポスト。 スタバ。YG くんと振動計算について話す。 PRA から ent…

寝たおす。 昼はリゾットと昨日の残り。 フンボルトの保険のことを調べる。 論文読み。 夜はリゾット残り+カニカマサラダ。 Azian Network で「のだめ」がやっている!

昼はうどん。スタマに買出し。 だいたい IR と局在の件は煮詰まってきたか。 夜は KB 夫妻を家に招く。Paul Champion は1日に3回くらいは研究メールがあるらしい。また、研究のことを play すると表現するあたりがすごい。北川先生もそんな感じらしい。その…

ベテランの日で休み(たぶん)。 とりあえず BU は水道工事中なので行かず。 ジョンから VCI 計算はまあいいんじゃないというメール。 昼は特になし。 洗濯。買出し。家の掃除などなど。 夜はチーズピザとチキンウィング。怪談 (1964) を見る。やはり耳なし…

KKC さんからいろいろ面白い結果が。 昼は焼きうどん。洗濯。 KKC さんの原稿直し。Gerhard の論文読み。スタバ。 YG くんと VCI の結果についてチャットしまくり。 夜はワインとパンとサラダを食いながら、ゴジラ対メカゴジラ (1974) を見る。沖縄いいなあ…

12時からヨンのセミナ。CPMD を使った量子ダイナミクスに向けての計算。なかなかいいじゃないすか。まあ、テクニカルな問題はいろいろありそうだが。 キムさんとちょっと話した後、地下でサンドイッチ。 KKC さんの結果を見る。なかなか興味深い。お疲れ様で…

昼は辛ラーメン。 いろいろドラフトを書き出す。 ヨンも交えて、Rossky さんと話す。なかなか気さくでいい人ですな。平田先生は彼の最初の PD だったんすな。分子研関係者の話題を少々。 その後スタバ。QM/MM と FMO の思想の違いなどについて。Ikeguchi-Kid…

歯の詰め物を入れなおしてもらう。ぱちーん。 昼はパスタ。ドイツの宿舎について考える。 VCI 計算のとりあえずのまとめを YG くんとジョンにメール。 スタバでコーヒーと豆を買う。linux の設定をいじっていたら、gnome がおかしくなってしまった。。 Yann …

Vh1 classics の80年代を代表する曲1位は Bon Jovi の Living on the prayer でしたか。まあ、そんなもんか。

昼はうどん。 久々にエコハに買出し。その後、家の中を掃除したり、磨いたり。 夜はすき焼き。The Pianist を見る。ホロコースト映画。

いま若者を表す言葉はなんなんでしょうねえ。。

久々に6キロマラソン。 昼は辛ラーメン。その後、BU。 VCI 計算のまとめ作り。 夜は焼きナス+サラダ。Wallace & Gromit, Three adventures を見る。 夜中の3時ごろまで下の住民(バカ)がパーティーをやっていて寝れず。。

森次さんによると、ボグダンは無事ドイツの Smith 研に着いたが、荷物が無くなったよう。。 MYST くんと今後何をやるかについて。 昼は焼きうどん。YOME さんが変な歌ばかり歌っている。。 やはり VCI はややこしい。振動計算とダイナミクス計算をどう折り合…

Elastic network model について教えてとインドからメール。 昼は辛ラーメン。 3角マップがなかなか出来ない。。で、KKC さんに聞く。 スタバ。その後、exciton model のことなどについて。やはりこれの改良は渋いか。 夜はアボガ丼+おでん残り。

夜に雨が降った模様。 Gerhard に家のこととか頼んでみる。ゲーテ大学のゲストハウスがよさげだが。。案の定、秘書さんに振られる。 12時からティナのセミナ。夏休みのスイス滞在の報告。Parrinello グループにいたとのこと。しかし、ORAC は使う気にならん…

町はあまりハロウィンらしい感じではないなあ。。 引き続き、Gaussian network model のお勉強。Elastic network model とは違うのか。。 TKM 論文はやっとレフリーに送られましたか。 昼はパスタ。 ENM の結果を KKC さんに送る。 夕方、子供が trick or tr…

急に思い立って elastic network model の勉強。 昼は Bertuzzi。その後、スタバ。 ボグダンは今日の夜に発つ筈だが、まだ忙しそうに何かをやっている。。 で、MYST くんに聞いてみたら、パスポートとか旅券の入ったバックパックをタクシーに置き忘れたとの…

今日から daylight saving が終わって、時計の針を1時間戻すことに。 昼はショウロン包など。 VCI 試し計算は続く。 夜はおでんと肉じゃが。鮫肌男と桃尻女を見る。 ヨンから両面ユニットは320ドルかかってもったいないかもとメール。

いきなり gaussden のアカウントが terminate されていた(^^ゞ。というわけで、早速ジョンにメール。 昼は焼きうどん。 KKC さんとメールのやりとり。ヨンから QM/MM 研究会のまとめが送られてくる。 夜はすき焼き。掛谷の問題などについて。Wayne Dyer のテ…

ハミーから海外学振の件でメールが来たので、KKB くんに振る。 昼はパスタ。 ついに、ボグダンのカラープリンタがお下がりで研究室プリンタに。 ジョンがモンタナに去っていった。その後、スーパー88で買い物。 夜はピザと野菜サラダ。しかし、ワインが開か…