昼は辛ラーメン。ウィルスバスターの契約期間更新。 Kate Bush を聞きながら作業。 夜は麻婆豆腐。 「心臓を貫かれて」は話の頂点へ。ゲイリーとマイケルの対話。そしてゲイリーの死。

ミオグロビンの相関関数を MD で計算しだす。

昼はそば。 エド・ウッドの Plan 9 from Outer Space を見るもやはり無茶苦茶退屈。眠そうになりながら何とか見終わる。 夜は親子丼。 「心臓を貫かれて」はいよいよ佳境。ゲイレンも死にました。

ジョンが化学科に入れないというので開けに行く。 昼はパスタ。５キロマラソン。 久々のタピオカミルクティー。 夜はお好み焼き。「心臓を貫かれて」はやっと下巻突入。 Analyze that を見る。まあ、手堅く面白いか。デ・ニーロもようやる。

A. Mitsutake, M. Kinoshita, Yuko Okamoto, F. Hirata, "Combination of the replica-exchange Monte Carlo method and the reference interaction site model theory for simulating a peptide molecule in aqueous solution," J. Phys. Chem. B 108 (2004…

ミオグロビンの基準振動計算や振動緩和計算を始める。 マットは順調に実験のセットアップもしているよう。

頂いた傘で登校。土佐の梅不しは好評のよう。 キムさんに $20 返してもらう。 昼は YOME さんのお兄さんを交えてインドカレー。 ５時ごろ、みなは化学科のパーティに行ってしまった。 MYST くんと PC クラスター導入の話など。 夜はたこ焼きなど。

疲れて不貞寝。MTNG くんからは例のファイルを DL させてもらう。 リンタオと同じ C.Brooks 研にいる Wonpil Imのセミナ聞き逃す。いかーん。Title: Insertion, folding, and assembly of membrane peptides/proteins studied by molecular simulation. 洗濯…

とうとう MYST くんのボストン行きが決定。 ミオグロビンでやろうとするも困難。キムさんに $20 貸す。 昼はうどん。その後、MIT でセミナ。しかし、基礎的な話で２時間が過ぎ、約束があるので退出。 ５時ごろから YOME さんの知り合いのTOR さんと MIT 近く…

Thirumalai のとこの PD の R. Dima のセミナ。Title: Source of instability in prion proteins: Glancing at early steps in the conformational transition. プリオンの話だが結局なぜαがβになるのかというメカニズムのことは分からず。プリティがよく質…

論文投稿でごたごたするもなんとか今日中に終わらす。

気温は零下。KKB くんは DS2019 をもらったようで、次はビザ取得か。 ジョンに言われて論文構成を大幅に変更。 昼はマクド。スタバ。小雪がぱらつく。 クレジットの件はインジョーのお陰でなんとか今回も助かる。いい加減な電話対応しないようにせんと。 論…

昼はパスタ。久々に５キロマラソン。 マイケル・ギルモアの「心臓を貫かれて」（Shot in the heart の日本語訳）を読み始める。 夜は鰻丼。

昼はキムチ入り辛ラーメン。 研究室のキャビンの整理。物理学会の申し込み。 マットや TKM さんに返事メール。 夜は昨日の残り。シュレック２を見る。

洗濯、掃除、買出し。 昼はうどん。 なげやりなティー。 新しいノートPCを買ったボクダンがWindows XP Skin のことを知りたがっているようなので、MTNG くん経由で教える羽目になるのか。 MTNG くんのもっているタンパク本の全コピー。こういうときに限って…

むむ、クレジットにおかしな動きが。というわけでインジョーに聞く。 昼はマクド。論文改訂は続く。PNAS 用にフォーマットを直す。 夜はリーガルシーフード。コプリーの方が混んでたんで、ボストンコモン近くの店の方に出向く。 スタバで初ジンジャーブレッ…

風が強いが寒くはない。Word で文字カウント。まあ４万文字程度か。 昼はインドカレー。おフランスのジョンから電話。ヨンにも指令。 スタバ。論文を更に改訂。 夜はうどん。 レクイエム・フォー・ア・ドリームを見る。今みるとまあ、軽い映画ですな。

K. Capelle, "A bird’s-eye view of density functional theory," cond-mat/0211443. まあ、やはりこれだけではどうにもならん(^^ゞ。

ボクダンによるとジョンから論文の〆切延ばすと電話があったらしい。 PNAS の投稿規程も調べる。47000 文字数以下でないとまずいのか。そんなこと気にせず書いていた(^_^;)。

屈強そうな二人組が家の周りを修理している。 昼はパスタ。 記事を書いた「アンサンブル」が日本から届く。旅費も戻ってくる。 スタバ。Capelle のレビューを使ってDFT のお勉強開始。 夜はハンバーグ。

昼はMTNG くんとインドカレー。 論文書き書き。ジョンはフランスに行くことになり、論文も今日中に仕上げなければいかんことに。 ヨンやリナと DFT セミナ打ち合わせ。 スタバ。なんとかいい加減な第一稿を仕上げる。 夜はうどん。

葛根湯などを飲んで家にこもる。 昼はパン。論文の〆切が今月中ということで焦る。がどうにもならん。 夜は麻婆豆腐。ティム・アレンの Galaxy Quest が何回もやっている。

昼まで寝る。洗濯。 ハリポタ「アズカバンの囚人」と Dawn of the dead リメイク版 (2004) を見る。後者はなかなかの出来。 夜は栗。

昼は昨日の残り。 サンクスギビングで何か安売りがしてないかとパークストリートへ。特に何もなく、歩いてコプリーへ。風邪を引きかける。 ショッピングモール内ですごい日本人アート（？）集団を見かける。スタバ。ビーチボーイズのクリスマスアルバムやス…

しかし、はてなは何をやっておるのだ。 シカゴは寒そうだなあ。 昼は辛ラーメン。MYZK さんとも久々にメールのやりとり。 論文でっち上げは続く。VER の理論のまとめ。 夜はチキンの丸焼きなど。ディボース・ショウを途中まで見る。

PCA の計算やり直し。論文でっち上げは続く。VER の実験のまとめ。 うーむ、日本に学会で行くときの旅行代が出ない可能性があるとは厳しいのう。その後、なんとか出ることに（付記）。

サンクスギビング用買出し。洗濯。 昼はインドカレー。明日から MTNG くんはシカゴの友達に会いに行くそうな。 夜はうどん。

うーむ。CHARMM パラメータを変えると VER もかなり変わります。当たり前か。 PCA はいろいろと混乱。MTNG くんにいろいろ聞く。

アランのセミナで粗視化モデルを使った MD 計算について。水素結合の扱い方がネック。 昼はタイ料理（トムヤンクンそば）。 夜は鰻丼。仕事に関する考え方でもめる。

PNAS 用に構想を練る。パラメータを変えたときの計算も始める。