TKM さんのアリゾナ紀行。

Head-Gordon のところの PD の Barry Dunietz 氏によるセミナ：“CO electro-oxidation studied by extended models within DFT and Dissociation of ligated heme: A time-dependent study.” TDDFT を使った諸計算。 その後、BU 付近のタイ料理屋へ。Kim さ…

J. Chen, X.X. Yi, H.S. Song, and L. Zhou, “Noise induced entanglement,” quant-ph/0309202

朝は歩きにくかったが、ようやく BU 橋も歩道が雪掻きされる。 昼はサンドイッチ。チキンサンドが当たりだということに漸く気づく。 その後、PCHEM のセミナ。スピーカーはリンタオで、例の話。 その後、カオスとエンタングルメントでもう一花咲かせないか考…

T. Van Voorhis and E.J. Heller, “Similarity transformed semiclassical dynamics”, J. Chem. Phys. 119, 12153 (2003); M. Nakano, R. Kishi, and T. Nitta, “Monte Carlo wave-function approach to the quantum-phase dynamics of a dissipative molecu…

あいかわらずBU橋が歩きにくい。 昼はコンビニ寿司。 Bu-Straub 論文を三度チェックしていたらちょっと気になるところを発見。そこからいろいろずるずると。 インテルのコンパイラの件は高いので、まずBU の Information technology office に聞けということ…

X. Yu and D. M. Leitner, “Anomalous diffusion of vibrational energy in proteins,” J. Chem. Phys. 119, 12673 (2003); X. Yu, J. Park, and D. M. Leitner, “Thermodynamics of protein hydration computed by molecular dynamics and normal modes,” J…

今日の家の前。TKM 解と戯れ。しかし、うまくいかん(^^ゞ。 昼はラーメン。BU橋の辺りの雪の残りが酷い。 なにかジョンは大学関係のことで苛立っているよう。プリティ恐れて近づかず(^^ゞ。ちょっと話して単位が変なのかどうなのかはっきりさせろということ…

昼はピザパン。 図書館に行き、The Band の南十字星や Paul のライブ盤 Back in the US、Stones の諸作を借りる。ついでに Boston Common の様子も窺う。 夜は鰻丼。

Vio に雪かきとかどうするのか聞く。 午後はさらなる防寒着を買うために、Fenway の REI まで出向く。近くのバス停に行くまでで一苦労。１時間くらいの試着の後、冬用のブーツを購入。早速それを履いて家まで歩く。 夜はポーク残りに一工夫。

N.-V. Buchete, J. E. Straub and D. Thirumalai, “Aniostropic coarse-grained statistical potentials improve the abilitiy to identify nativelike protein structures,” J. Chem. Phys. 118, 7658-7671 (2003). その Vio の論文。

セミナは Alan で、Vio もやっていた statistics-based potential をタンパクの２量体や３量体に使ったらどうなるかという話。まだまだうまく行かないらしい。 昼はパスタ。その後、ノートをジョンとリンタオに送る。YOME さん、プリティと喫茶店にしけこむ…

Q. Shi and E. Geva, “Semiclassical theory of vibrational energy relaxation in the condensed phase,” J. Phys. Chem. A 107, 9059 (2003); “Vibrational energy relaxation in liquid oxgen from a semiclassical molecular dynamics simulation,” ibid…

Harvard sq. の Fleet 銀行まで行って、Injoo にカードのことなどをいろいろ聞く。 その後、Harvard の生協。やはり本はここらの大学で一番あるか。 その後、ラーメンを食って、防寒着探し。Colombia の $300 のスキーウェアのようなものを買ってしまう。 夜…

A. Roitberg, R.B. Gerber, R. Elber, and M.A. Ratner, “Anharmonic Wave Functions of Proteins: Quantum Self-Consistent Field Calculations of BPTI,” Science, 268, 1319 (1995). いまなら cytochrome c でもできるはず。

しかし、気温は０度近く。Stuchebrukhov さんからリプリント届く。 昼は焼きうどん。 BU-MIT-Harvard セミナは Gezelter さんで、“Simulation of Slow, Condensed Phases: What we can learn from Alloying Nanoparticles and Rippling Membranes.” 寒いので…

P. Jungwirth and R.B. Gerber, “Quantum Molecular Dynamics of Ultrafast Processes in Large Polyatomic Systems,” Chem. Rev. 99, 1583 (1999). OKSM さんは最近この手のをやってるのかなあ。

コンパイラの問題はバージョンアップで解決。 吹雪く中、Gezelter さんとインド昼飯。清水寧さや小林君のような alloying の話をポテンシャルを量子化学的に計算してもっと realistic にやっているよう。 VSCF のことも調べだす。 コンパイラの問題は fortra…

明日は最高気温が摂氏０度だとか(^^ゞ。 TB 検診に行って、BCG のことを聞くと、それは１０年くらいしか有効でないので、TB は他から来た可能性が高い、よって薬を飲み続けろということに。かなぴー。 昼はパスタ。インテルのフォートランをインストールしよ…