T. Vreven and K. Morokuma, “Investigation of the S0 à S1 excitation in bacteriorhodopsin with the ONIOM(MO:MM) hybrid method,” Theor. Chem. Acc. 109, 125 (2003). ONIOM は Gaussian03 には標準装備のようです。

やや涼しいくらいか。 John と inspiron 3800 の battery をどう買うかについて。 よかった、今月は税金引かれてなかった(^_^;)。 昼は焼きそば。John と Lintao に project がらみでメール。 TKM さんの新データをもとに、TFM 論文をどうするかについて悩む…

やや温度下がる。 昼はソーメン。Freedom trail を半分ほど歩く。 夜はハンバーグ。いろいろ作業。

やや温度下がる。 昼はカレー。Back to the future 2, 3 を見る。まあ、いい話ですね(^_^;)。 そして、MRMT さん、ご結婚おめでとうございます(^_^)。

W.G. Noid, G.S. Ezra, and R.F. Loring, “Optical response functions with semiclassical dynamics,” J. Chem. Phys. 119, 1003 (2003). やはりやられたか(^^ゞ。ま、誰でも考えそうなことですが。

真夏日。エアコンをネットで注文。スタマで買ったほうがよかったか(^^ゞ。 昼はソーメン。Cygwin でちょこちょこやりだす。「分子動力学法とモンテカルロ法」（片岡洋右著）を読みながら。にしても５階は暑い。 Tea party は３階でやることになったらしい。B…

K. A. Merchant, W.G. Noid, D.E. Thompson, R. Akiyama, R. Loring, and M.D. Fayer, “Structural assignments and dynamics of the A substates of MbCO: Spectrally resolved vibrational echo experiments and molecular dynamics simulations,” J. Phys…

真夏日。昼は BU pub で Nediaka とサンドイッチ。 Bogdan によると９月の頭までこの暑さ続くとか。 その後、Nediaka のセミナで Proton-Coupled Electron Transfer の話。うーぬ、概念的に PCET が何なのか分かっていない(^^ゞ。 ああ、John に言われている…

S. Hammes-Schiffer, “Theoretical perspectives on proton-coupled electron transfer reactions,” Acc. Chem. Res. 34, 273 (2001).

真夏日。今週中は続くらしい。ひえ〜。 昼は炒飯。TFM 論文 v.1.3.1 を TM に送る。 Hammes-Schiffer のところの学生さん (Nediaka Iordanova) が PD として Straub 研に来るらしい。David Coker 研との共同 PD ということらしいが。 John からまた新しいプ…

真夏日。午前中は××ヘ。 その後、目医者に電話してアポとるも、保険が利くかどうか微妙。 昼はパスタ。指を包丁で１０年ぶりに切る YOME さん(^^ゞ。 おお、コップが洗われている。すまん、preeti. バスの通るところを自転車で走っていた YOME さん、警察に…

Y. Arasaki, K. Takatsuka, K. Wang, and V. McKoy, “Pump-probe photoionization study of the passage and bifurcation of a quantum wavepacket across an avoided crossing,” Phys. Rev. Lett. 90, 248303 (2003).

TFM 論文 v.1.3 の直し（続き）。大体終わったので TKM さんに送る。 昼オムライス。ベッドを $100 で買うも微妙(^^ゞ。 YOME さんと BU の××へ。その後、自転車屋へ。Alan に目医者のことも聞く。 Linato の cyt c 中の CD bond の振動緩和の計算と、Silber…

洗濯。電灯が切れているので買出し。 電子レンジを $25 で買うも微妙(^^ゞ。 夜和風ハンバーグ。

Fenway AMC theater に Matrix reloaded ($7) を見に行く。 うーむ、会話が分からんね(^^ゞ。あとでいろいろ調べる。 夜パスタ。

J.T. Sage, C. Paxson, G.R.A. Wyllie, W. Sturhahn, S.M. Durbin, P.M. Champion, E.E. Alp, and W.R. Scheidt, “Nuclear resonance vibrational spectroscopy of a protein active-site mimic,” J. Phys.: Cond. Mat. 13, 7707 (2001). Lintaoが使っていた…

YOME さん CELOP。こっちは９時半から chat。のはずが John 来ず(^^ゞ。 その間に TFM 論文 ver.1.3 を直す。来週くらいには何とかなりそうか(^^ゞ。 その後、議論。Cytochrome c の CH bond の振動緩和を低温でやるかと。 昼はパスタ。YOME さんシエスタ。 …

A. Torcini, R. Livi, and A. Politi, “A dynamical approach to protein folding,” cond-mat/0103270.

John にノートをメール。Chat は明日に延長。 やたら人気の多いBUキャンパス。 昼はパスタ。図書館に寄り、Prog. Theor. Phys. も置いてあることを確認(^^ゞ。さて手を動かさんと。Parminder が部屋で何か秘密の会合をやっているよう。 夜は牛肉炒め。

D.M. Leitner and P.G. Wolynes, “Quantization of the stochastic pump model of Arnold diffusion,” Phys. Rev. Lett. 79, 55 (1997); “Intramolecular energy flow in the condensed phase: effects of dephasing on localization in the quantum stochas…

Dick が来て、台所臭い問題について話し合う。結論：漂白剤 (bleach) を買って拭けと。 昼は炒飯。出ようとするも車に水を（大量に）ひっかけられる(^^ゞ。その後、stochastic pump model 周辺を調べる。 John と明日の議論 (chat) 用にまとめ。 夜は焼き魚…

C.C. Martens and W.P. Reinhardt, “Nonlinear dynamics of methyl rotation and intramolecular energy diffusion in p-fluorotoluene,” J. Chem. Phys. 93, 5621 (1990).

Check を銀行に預ける。 おっと、化学科の建物が火事らしい(^^ゞ。外に出る人々。実際は何も起こっていない様子。Lintao に Chris のことを更に聞いたりして。 昼はお好み焼き。Martens-Reinhardt などを読む。DELL は何を買って、OS をどうするかで悩む。 …

M. Braxenthaler, R. Unger, D. Auerbach, J.A. Given, and J. Moult, “Chaos in protein dynamics,” Proteins 29:417-425 (1997).

YOME さん CELOP。 窪谷さんから久々にメールをいただく。TKM さんからもメール。 一旦帰ろうかと思ったら自転車が盗まれている！車輪しか残っていない(^^ゞ。と思ったら BU 警察が犯人を捕まえてくれていた模様。 昼はパスタ。で警察に行き、１時間ほど諸手…

暑い。 昼焼きそば。 Copley に行っていろいろと買い物。サンダルとか服とか。Chilled cappuccino と言っても温かいのが出てくる shopping mall 内のサテンであった。 夜はハンバーグ。

越智さんからでかい掃除機ゲット ($25)。 その後、Organic furniture で机ゲット ($50)。 昼抜き。夜は。。

隣の駐車場で無軌道そうな若者たちと大人が口論。 YOME さん CELOP。Parminder たちが私のために別の cabin をきれいにしてくれたらしい(^_^)。 TKM さんから来た原稿に手を入れる。 昼はパスタ。その後も改訂作業。 ３時から Bogdan のセミナ。Title: “A do…

W.H. Zurek, “Decoherence and the transition from quantum to classical --- REVISITED,” quant-ph/0306072. Zurekがこういう顔をしているとは！

Jennifer Lopez はすごい。OKSM さんの論文を読む。 そうかバニラ味のコーラこれから日本発売なのか。まずいっすよ。 昼はうどん。Boston Metroでイランの双生児の話を知る。 Duan-Kollman の review 記事 (IBM Sys. J. 40, 297 (2001)) から示唆をうける。 …