直輸入インドカレーのもと。

Introduction to Path-Integral Methods in Physics and Polymer Science作者: F. W. Weigel出版社/メーカー: World Scientific Pub Co Inc発売日: 1986/04/01メディア: ハードカバー購入: 1人 クリック: 3回この商品を含むブログ (1件) を見る朝、戸田さん…

９時半から小松崎さんのトーク。午前中は馬場さんの LES の話、午後は Chin-Biu のεマシンの話。後者はだいぶ分かってきたような。。大風呂敷を広げるのはいいことと(^^ゞ。われわれがそれをやるわけにもいかんと。 また、KDR さんからゲラルドの論文を振ら…

Yibing Shan, John L. Klepeis, Michael P. Eastwood, Ron O. Dror, and David E. Shaw, Gaussian split Ewald: A fast Ewald mesh method for molecular simulation, J. Chem. Phys. 122, 054101 (2005).

ちょっと頭痛ぎみなので、さぼってしまう。。 KKC さんに揺らぎの可視化の図を送る。 昼はメキシカンビーン。 ３時から雑誌会。Shaw らの electrostatic force の計算の仕方の紹介。しかし、そんなに速くなさそう。 その後、島さんの雲のシミュレーションの…

戸田さんの４時間トーク。invariant manifold を昨日のカーネル PCA のようなやり方で detect できるのか、という話と、MD のトラジェクトリの時系列解析の話。とにかく Langevin ダイナミクスはお気に召さない感じ。 昼は小松崎さんらと一緒に。自由エネル…

９時半から階層性研究会。 福水さんの Kernel 法を用いた、統計量の相関や因果律の検定について４時間。ひじょうにすっきりした話。 ４時からは自分の発表だが、あまり伝わらず。string 法は省いたほうがよかったか。。 足立さんの最近の１００ページ論文は…

Visit ホームページ. 主に流体系のシミュレーション表示用。

強風の中、洗濯。 昼はおろし大根つきトンカツ。TRD さんの熊本話など。 １時半から Visit の説明会。だが行かず。。後で話を聞く。 発表の準備準備。なぜか今頃ジョンからメールが。。 夜はチーズパスタとガーリックトースト。

IIDK さんから、Nature のスパコンに関しての記事がメールされてくる。 昼は牛肉中華風。こうインフルの話をしている間にも何か重要な話題があるのかもしれん。 ヒ素入りカレーの成分解析は Spring-8 でやったんですか。現代化学より。 MTNG くんと string …

James MacFadyen, Jeff Wereszczynski, and Ioan Andricioaei, Directionally negative friction: A method for enhanced sampling of rare event kinetics, J. Chem. Phys. 128, 114112 (2008). Negative friction dynamics を Onsager-Machlup 汎関数を使…

雑誌会準備。 昼はチャーハン餃子。 MRTG さんはインフルエンザと間違えられた顛末を。 ３時から雑誌会。飯高さんもやってくる。Andricioaei の negative friction dynamics の話。Domcke 研出身のアンドレイとも話す。その後、USI さんに写真をとってと言わ…

Path Integrals in Quantum Mechanics, Statistics, Polymer Physics, and Financial Markets作者: Hagen Kleinert出版社/メーカー: World Scientific Pub Co Inc発売日: 2006/09/30メディア: ペーパーバック クリック: 4回この商品を含むブログ (1件) を見…

洗濯。 昼はアジフライ。インフルエンザ関東上陸か、について。そうではなかったっぽい。 KDR さんと議論。TRD さんも交えてヘシアンの話。自動微分を試みている人は結構いるらしい。 コーヒータイムはプロジェクトの行方。粛々と。 また２次元の問題に戻る…

長袖。 昼は鶏肉のパン粉揚げ。 思い立って、古い Physics Today を漁る。収穫なし。。 N次元ポテンシャル作りから、フォースとヘシアンの計算へ。 コーヒータイムは NEC 撤退の続報や蛋白質化学会について。 いまさら TPS の勉強。 夜は。。

今日は涼しい。 昼は豚の味噌焼き。医者が奥さんだといいなあ、という話。 NEC と日立、スパコンから撤退ですか。先週の丸の内での話は何だったのか。 N次元モデルポテンシャル作り。 コーヒータイムは NEC の撤退について。いろいろ裏があるのかもしれん。 …

G.S. Ezra, Reversible measure-preserving integrators for non-Hamiltonian systems, J. Chem. Phys. 125 (2006) 034104.

相変わらず蒸し暑い。昨日から計算機が込んでいる。 昼はピリ辛魚フライ。横浜市大の学生気質、インフル対策など。 ４時から雑誌会。Ezra の measure preserving integrator について。 カンヌオープニングはピクサーの「カールじいさんの空飛ぶ家」ですか。…

蒸し暑いので半袖。 SG さんからメール。IRC もやろうということに。 昼はハンバーグ。和光市市長選のことなど。 コーヒータイムは自動微分やビザのことなど。 TRD さんの提案で、高次元モデル系を考えてみる。奥島さんの random funnel model を使うのがい…

昨日から引き続き暑い。もう３０度くらいいってそう。洗濯。 昼は豚キムチラーメン。新型インフルエンザのことなど。 コーヒータイムは先週の丸の内ミーティングのことなど。ヘシアンの計算もいい加減やらんといかんなあ。。なんとか自動微分とかでできない…

寝たおした。。 パスサンプリングコードの MPI 化。 昼はホッケ。その後、皆で丸の内へ。 ４時間ほどスパコン関係のレクチャー漬け。 その後、理研に戻る。MPI 化成功か。 夜はチーズパスタ。

S. Omori, S. Fuchigami, M. Ikeguchi, and A. Kidera, Linear response theory in dihedral angle space for protein structural change upon ligand binding, J. Comp. Chem. (2009): DOI 10.1002/jcc.21269.

久々に理研。 昼はオムライス。ＧＷにどこに行ったかなど。こちらは電車で２０分の川越に行きました。 Tully's でサプライズパーティ用の準備をしている人々。そういう社交的なものにはここ５年ほど加わらなかったねえ。。 MTNG くんに MPI のことをいろいろ…

細野晴臣の歌謡曲~20世紀BOXアーティスト: オムニバス,いしだあゆみ,やまがたすみこ,小坂忠,MANNA,竹内まりや,ブレッド&バター,クレスト・フォー・シンガーズ,久保田麻琴,シーナ&ロケット出版社/メーカー: コロムビアミュージックエンタテインメント発売日: …