2008-04-01から1ヶ月間の記事一覧

ENM 計算に関するノート書き。で、KKC さんに送る。 昼は生協。アビーがよく喋るなあ。今日はアリコの医者に無料でマッサージをしてもらった話など(もちろん冗談)。 急かしたら、ジョンからメール。 経路計算に関するノートを改訂して関係者に送る。 ピョ…

Nordwest Zentrum に歩いて行くも、郵便局は9時にならないと開いていなかった。。というわけでスタバ。学振や GEZ 関連のメールを出す。 電車に乗って、Hauptwache のミキライゼンに行き、旅券を購入。 その後、家に一旦帰って寿司第2弾を持っていく。トー…

酵素の ENM 計算は続く。 昼は生協。セミナの話など。聞いた1週間後にはすべて忘れていると皆。。 YOME さんの寿司作りを手伝いにいったん帰宅。もって帰って皆に振舞う。相変わらずアリコは海苔を食えず。ライナーの嫁さん(リサ)からはレシピをライナー…

大学で諸作業。 HYS さんからメール。バルセロナ行き確定か(われわれの)。 昼は遅めのパスタ。 昼寝。 夜はひさびさに豚の角煮。

TV Talk Talk でやったいた GQ の CM が面白いなあ。また、ドイツの工業美術学校生たちが日本で技を競うのをやっていた。 ちょっと出て洗濯。必ず洗濯がうまくいかない人がいる。。 昼はパスタ。その後、ゲーテ大。YOME さんはスペインのことを調べだす。 EN…

いろいろ事務処理。 昼はピョン、トーマスと生協。αへリックスでの熱伝導や、タンパクのプロトネーションの話など。 3時から Nicola Spalding のセミナ。には行かず。。 elastic network 関係の論文読み。ゲラルドから質問が来て考える。 KKC さんと今後の…

G. Li and Q. Cui, A coarse-grained normal mode approach for macromolecules: An efficient implementation and application to Ca2+-ATPase, Biophys. J. 83 (2002) 2457-2474.

なんとか学振の書類を Word+openoffice で作る。pdf 化したところで全データが消去。危なかった。。 TNMR さんからは論文に関していろいろ辛口コメント。 昼は生協。アビーがこれ(ブロッコリ炒め)で4ユーロと文句。いまはブロッコリが高いシーズンなのか…

W. Zheng, B.R. Brooks, and G. Hummer, Protein Conformational transitions explored by mixed elastic network models, Proteins 69 (2007) 43-57.

TNMR さんに研究会のことなどについていろいろ問い合わせ。 RTB に関する論文をいろいろ読む。擬縮退摂動論に似ているので、YG くんにも振ってみる。 昼は生協。アリコは彼女と。こちらは女体盛りの話などを。。 学振の書類を書こうとするも Word がフリーズ…

小テスト採点。なかなか点をやるのが難しい。。 なんとか旅費は帰国前に出してもらうことに。 昼は生協。トーマスとちょっとロドプシン関係の話などを。 ゲラルドの原稿を更に直して送る。その後、共著者にも送る。 論文査定。まあ、通す。 ゲラルドと話して…

ゲーテ大に行きかけるも、コーヒーを忘れて引き返す。。 いろいろメール処理。TKM さんにはいろいろ処理していただいて感謝。 まずは催促の入っている論文査定から。相変わらず絡み合い論文。 昼は生協。ラルスは先週 NY に10日間行っていたと。 YG くんに…

昼はおかゆ残り。 フランクフルト動物園に行く。なかなか広く、動物がどこにいるかが分かりにくい。。日本の狭い動物園とは違うか。オラウータンの長老がよかったか。 夜はパスタ。Smallville を見る。

肌寒い。 午前のセッション。Frank Noe や Bettina Keller の構造転移経路解析の話など。後者はアリコのやっていることに非常に近い。 昼は Jeremy Smith 研の人たちと一緒になる。エジプト人ポスドクが Manz 研出身で TKTK 研のことを知っていた。 午後のセ…

Huenfeld Workshop. 日本の人もぜひ参加するといいです。

フランクフルト南駅で待ち合わせるも早く行き過ぎて、マックでコーヒー。 皆と合流してまず Fulda に行き、それから Huenfeld へ。ラウラはイタリア人の彼氏も連れてきていた。 昼は僧院で。相変わらずなかなかよい。みなで「生協よりいい」という話を。 そ…

スライド調整。YG くんとチャット。 昼は生協。なんとマヤは Huenfeld 行かないのか。。日本行きの話などを。 サニーは無事ポスターをもってきてくれたと。明日の電車のことなど打ち合わせ。 スライド練習。 夜は肉じゃが残りとイカトマト炒め。

Huenfeld のスライド直し。誰がポスター取りに行くんだろう。。 昼はアビーと。昨日の話のフォローアップなどを聞く。インドは土日でも働く人多いと。 スライド直しは続く。ポスターはサニーが取りに行くことに。 擬縮退摂動論を勉強することに。。REWE で買…

YG くんとチャット。射影演算子法を分子系にいかに使うかなど。 昼は生協。去年の Huenfeld の思い出など。 ライナーにポスター印刷をお願いする。 アビーのセミナ。Site-Site interaction in Macromolecule. これはよく分からん。 YG くんの擬縮退摂動論を…

最後の保険代振込み。 昼は生協。アビーと寒空の下で食べる。まだドイツ語は挨拶くらいしかできんと。同じだな。。アビーは Straub 研にも行こうと思っていたらしい。しかし、ヨーロッパのほうがプレッシャーなさそうだからと。 YG くんとチャット。ポスター…

K.S. Suslick and D.J. Flannigan, Inside a Collaspsing Bubble: Sonoluminescence and the Conditions During Cavitation, Annu. Rev. Phys. Chem. 59 (2008) 659. OT 研にいた頃に調べていたのが懐かしい。まだ、single bubble SL は謎だらけらしいですな…

昼はカレー残り。 別ルートでゲーテ大に行ってみる。 発表用のパワポファイル作り。A0 ポスターのほうは pdf ファイルへの変換がうまくいかなさそうなので、openoffice に移行。しかし、なぜこんなにパワポは遅くなったのか。。 夜はサラダ+春巻き。

久々に快晴。洗濯するために電車で遠出。なかなかうまく洗濯できない親子に会う。 洗濯中はユングに関するコリン・ウィルソンの本を読む。 昼は辛ラーメン。その後、ゲーテ大まで歩く。

プリペイド携帯が使える!やっぱ楽。 FEDER の中身を見るも、どうも振動数をどう代入するのかで分からなくなる。 昼は生協。アビーのまねでヒンズー語(?)を喋るアリコ。なぜ首を振るのか、とローラに指摘される。インド人は喋るときに別に首を振らんとア…

TKM さんにメール。ゲラルドにもアミドIIの件でメール。 Langevin を逆に時間発展させるというアホなことをしてしまう。。 昼は生協。アビーによるとインドで職を得るのは非常に簡単とのこと。インドに来ればと言われる。。 YOME さん vodafone のプリペイド…

R.D. Astumian, The unreasonable effectiveness of equilibrium theory for interpreting nonequilibrium experiments, Am. J. Phys. 74 (2006) 683.

ゲラルドとモードの数を変えたらどうなるのか、という話。 昼は生協。Young Yakuza の話など。 Astumian の論文を見ながら、Langevin ダイナミクスをやってみる。 REWE で買い物。 夜はカルボナーラ。

Z. Gamim, H. Sung, A.W. Smith, L.P. Deflores, K.C. Jones, and A. Tokmakoff, Amide I Two-dimensional Infrared Spectroscopy of Proteins, Acc. Chem. Res. 41 (2008) 432-441. Tokmakoff らしいシャープなレビュー。

結構寒い。 Huenfeld のスライド作りを始める。 昼は生協でいい加減な野菜料理。アビーはもう昼飯は家で作ってもってくると。 ゲラルドにここ1週間のまとめメール書き。 その後、Nordwest に買い物。72 のバスに乗ってみる。 夜は焼き鮭。Young Yakuza をテ…

Xiaolin Chengb, Benzhuo Lua, Barry Granta, Richard J. Lawb, and J. Andrew McCammon, Channel Opening Motion of α7 Nicotinic Acetylcholine Receptor as Suggested by Normal Mode Analysis, J. Mol. Biol. 355 (2006) 310-324. これは参考になる。