ヨンのデータを見て考える。

気温は高くないが、湿度が高い。あとハリケーンの影響か何かで風が強い。 FCGM くんは１０月末に来ると。 １０時からフリー議論。ヨンの NMA の ab initio 計算の話とボグダンの Krivov-Karplus の transition disconnectivity graph (TRDG) の話。小松崎研…

Amber のことを調べる。

８時ごろ起きる。久々にベーコンエッグ。 YMKW くんとセントラル駅まで行き、そこから South Station まで。Mansfield に向けて旅立っていきました（でも、金曜にまた来る予定）。 吾妻ひでおの「失踪日記」を読みながら BU へ。 昼は MYST くんとカンポ。サ…

とりあえずメチオニン関係をまとめて、マットとジョンにメール。問題がいろいろ。すぐにジョンから返事。

昼はソーメン。 YOME さんは家の掃除洗濯などなど。 久々に扇風機も掃除する。 ボグダンからダイナミックアレーのことを聞かれたが分からんので、MYST くんに廻す(^^ゞ。お、MYST くんはやっと DELL のマシンが到着したようだなあ。長かった。。がもう一悶着…

昼はインドカレー。野菜カレーとナスカレーにするが、これがいける。定番メニューに加えよう。 なんかだるいので BU には行かず、スタマで買い物して、家に帰る。 夜は枝豆など。 DNA と癌治療の DVD を見る。

何か外で若者が騒がしくてよく寝れん。 YOME さんがコンコルドに行くということで、朝早く起きて、ポーターまで自転車を漕ぐ。TMK んやジョンソン（とその旦那）に会う。 その後、BU。 昼はカンポでサンドイッチ（ローズマリーチキン）。しかし、眠いので、…

うーむ、実験との兼ね合いは悪い(^^ゞ。CHARMM だけでなく、Amber でも調べんといかんかな。

計算は終わったので、解析をしないと。 昼はマクド。 飯高さんに９月号のパリティの記事をファックスしてもらう。生嶋くんの記事と、「パリティ誌の危機」を(^^ゞ。とりあえず MYST くんに見せる。後で後者は冗談だと知る。 スタバで冷コー。 ラッセルが Str…

いろんな ab initio のレベルでいろんな conformer を調べることに。しかし、CHARMM はどうやら VDW force でメチル基を押えているみたいだなあ。メチオニンもそうだったが、やはりメチル基がらみは経験的ポテンシャルじゃダメやね。

気がついたら弟の子供が２歳になってた。。 昼はそーめん。 ２時からジョン、ヨンと NMA 問題に関して会合。 論文校正を郵送。スタバで冷コー。ナポレオン・ダイナマイトの Quote book が出ているのを知る。 ボグダンはまたビザ関係で明日 NY に行くと。今度…

基準振動本直し終了。NMA 論文も第２ドラフトをジョンに送る。マットからは実験論文ドラフトが送られてくる。ヨンからも ab initio 計算まとめが来る。

ラッセルから、Frank Zappa 60 年代と、70年代中半までの音源が入ったCDをもらう。どうやって圧縮したんだ、こりゃ。と思ったら、transcd.com で買ったとのこと。 キムさんのセミナ。Wang-Landau サンプリングの改良版を使って、タンパクビーズモデルのフォ…

振動緩和の再計算。基準振動本も直そうとするといろいろ問題が出てきて難しい。

Bakker の論文を読み、適当に式変形しているところを発見。しかし、思想としては間違ってなさそうなのが困る。どうするか。 昼は MYST くんとラッセルとカンポ。Cowboy Bebop から始まって、オタク、NEET、パラサイトワイフについて語る。Frank Zappa も好き…

基準振動本の校正が〆切後も続く。Bakker の結果をどのように反映させるか。 タンパク水プロジェクトはとりあえず平衡化まで終了。で、これからどうするかだ(^^ゞ。

やはり昨日、フェンウェイ球場でストーンズのライブがあったようだなあ。 お。ジョンが来てる。しかし、接触できず。 YOME さんは×××の件で電話でいろいろと謀略。 昼は冷やしうどん。 ３時からラッセル、ジョンと研究室ホムペ作り会議。しかし、途中で脱落…

蒸し暑い。Monk を見る。 昼はそーめん。 ヨンから NMA の別データが送られてくる。というか、CHARMM パラメータ論文を見たら、私のNMA 構造の方が間違っているではないか。。さて、何が問題なのか。。 MYZK さんやマットにも返事せんと。MYZK さんの知り合…

Miss Congeniality 2 を見る。途中だれるが、なんとか最後まで見れた。 その後、Newton 市の図書館まで自転車で行くという行動に出る。１０キロほど山あり谷ありのコース。途中、ボストンカレッジにも寄る。 昼は図書館近くの Whole Foods でサンドイッチや…

午前中はハーバードに行って、インジョーにいろいろ聞いたり頼んだりする。しかし、しばらく会わないうちにインジョー、ちょっとヤンキーなお姉さんのようになってました(^^ゞ。旦那は MIT で糖尿病研究のポスドクをしていて、現在職探し中だと。 昼はコプリ…

基準振動本原稿ゲラ刷りの校正。 昼は久々にマクド。サンドイッチが新発売してた。スタバは値段が上がってた。。 ラッセルとストラウブ研のホムペをどうするか話す。Swiki を使うとか。。 冷コー。もういい加減冷コーを卒業しないと。寒いし。MYST くんと喋…

宮崎さん（コロンビア大）のホムペ。ご意見は MYZK さんまで。

グループミーティング。ラッセルの基準振動のベクトル表記できるソフト、PCA をやるソフトの紹介。MYST くんは REMD などを使った計算の近況。ティナはやはり PCA の話。この結果は面白いことにつながりそうな予感。 その後、ヨンと非線形結合の計算の話。 …

QM/MM tutorial. やはり Gromacs に移るか。。

ジョンのメールがまた来て、それの処理。ナンシー（知らない人）からはジョンにメールしたけど返事がないという電話。 昼は MYST くんとカンポで。もうトマトバジルスープも飽きてきたか(^^ゞ。 その後、例のところに応募書類を出す。しかし、あと３日で届く…

結構涼しい。１８度くらい。 昼は（残り物）パスタ。結構いけます。 ジョンからメールが何通も来るので、それの処理。 ヨンは非線形結合を ab initio で計算するところまで行く。 件の書類書き。TNMR さんからは返事すぐ来る。KDR さん、TKTK 先生からも返事…

昼はギャラリアのフードコートで照り焼き鶏肉定食。 夜は豆腐など。 ジョセフ・キャンベルの「神話の力」を再び見る。

東北薬科大薬品物理化学教室。

危うく Paypal のフィッシング詐欺に引っかかりそうになった。あぶねえあぶねえ。 お、J magazine によると亜美由美がボストンに来るのか。 昼は中華街で点心。食べすぎ。３０ドルにもなってしまった。。 その後、いろいろ買い物。しかし、すぐに足が疲れる…